โรคระบบทางเดินหายใจส่วนบนเรื้อรังเป็นปัญหาที่พบได้บ่อยในแมวที่ไม่ได้รับการฉีดวัคซีน รูปแบบที่พบมากที่สุดเรียกว่าโรคจมูกอักเสบเรื้อรังหลังไวรัสหรือไม่ทราบสาเหตุ ในสภาวะนี้ การติดเชื้อไวรัส (เช่น เกิดจากไวรัสเริมในแมวหรือคาลิซิไวรัสในแมว) ทำให้เยื่อเมือกเริ่มต้นเสียหาย การติดเชื้อไวรัส ถึงกระนั้น สัญญาณเรื้อรังยังเกี่ยวข้องกับการติดเชื้อแบคทีเรียรองของโพรงจมูกที่เสียหาย ซึ่งอาจนำไปสู่โรคกระดูกอักเสบเรื้อรังของกระดูกบริเวณโพรงจมูก ซึ่งเป็นการติดเชื้อแบคทีเรียของกระดูกที่บอบบางภายในไซนัสจมูก การอักเสบเรื้อรังนี้สามารถทำให้เกิดการบิดเบี้ยวหรือทำลายโครงสร้างเหล่านี้ได้